Vláda Habsburků
Česká šlechta požádala katolické Habsburky o vládnutí v Čechách roku 1526. Rudolf II. vládl vzkvétajícímu městu a doplnil je o rozsáhlé sbírky obrazů a soch, neboť na svůj dvůr zval přední umělce. Velký požár v roce 1541 zničil většinu Malé Strany i část Hradčan. Následoval obrovský rozmach renesanční a barokní výstavby, jenž dal oběma čtvrtím řadu nádherných, dodnes stojících paláců a rezidencí. Druhá pražská defenestrace během nešťastného povstání roku 1618 roznítila třicetiletou válku, v níž zahynula čtvrtina českého obyvatelstva. Po ničivé bitvě na Bílé hoře se českého trůnu ujali rakouští Habsburkové a česká kultura v důsledku dlouhotrvající rakouské nadvlády a krutého potlačování politické a kulturní svobody ustrnula. Český jazyk i kultura byly potlačeny a země prodělala výrazný hospodářský pokles.